Лятното Зооучилище е програма, която се провежда от 1998 година през месеците юни и юли в сградата на Екологичния център и на територията на зоопарка. Всяка група се състои от 20 деца и има занимания в рамките на 5 дни (от понеделник до петък) от 10 до 16 часа по специално създадена програма за екологично образование в зоопаркови условия.

Концепцията и програмата за Лятното зооучилище са създадени от екипа на Екологичния център. Те са разработени за две възрастови групи – за деца от 7 до 9 години и за деца от 10 до 12 години. Участниците, навършили 7 години, е необходимо да са завършили 1-ви клас и да имат училищни навици. За двете програми има и специално създадени учебни тетрадки с цветни илюстрации.

Петдневната програма е уникална по съдържание и може да се прилага само в условията на Софийския зоопарк. Създадена е на базата на опита и разработки на подобни образователни центрове в зоопаркове в цял свят и се основава на нестандартни и забавни методи за поднасяне на информацията, включени са много игри, възможности за творческа изява и индивидуални и групови дейности. Неотменна част от учебната програма са контактът и грижите за животните в Екологичния център.